Tämä on toinen merkittävä rakenteellinen eri Merinon ja alpakan välillä. Lähtökohtaisesti kaikki villat sisältävät ilmaa, joka luo villalle ominaisen kyvyn eristää lämpöä. Molemmista villoista löytyy tämä rakenne, mutta Alpakan villan sisältää huomattavasti enemmän näitä ilmataskuja ja eristää käyttäjänsä paremmin.
Vaikka Merinon kuitu on pidempi ja paksumpi, on villa vähemmän tehokas lämpöeristäjä verrattuna alpakoihin(5). Lähteestä riippuen alpakan villan erityskyky Merinoon verrattuna on 20-400% (3,4). Ilmavat kuidut tekevät tuotteesta kevyemmän ja mahdollistavat lämpimän tuotteen vähemmällä materiaalilla.
Erot villojen lämmöneristävyydessä liittyy kuitujen sisäisen rakenteen eroihin. Merinolampaan villa koostuu yhdestä kuitutyypistä, jossa ei ole ydintä, kun taas vain pieni osa alpakan kuiduista on ilman ydintä(4). Tämä ydin muodostaa kuituun ilmatiloja ja lisää villan lämmöneristystä luoden alpakasta tehokkaan lämmöneristäjän(5).